В 18 веке на территории усадьбы располагался загородный двор бояр Салтыковых. В 1812 году пожар уничтожил деревянные строения во дворе Болтина, а главный дом и службы так сильно пострадали, что хозяину пришлось переехать в свое нижегородское имение. В 1818 году хозяином усадьбы стал генерал-майор Измайловского полка Александр Иванович Талызин — участник Бородинского сражения. После ремонта главный дом и служебный корпус приобрели одинаковые каменные аркады с балконами над ними, создававшие впечатление единого архитектурного ансамбля. Фасад господского особняка с тех пор дошел до нас без изменения. После смерти А. И. Талызина в августе 1847 года дом достался его родственнице — титулярной советнице Талызиной, а затем был куплен графом Александром Петровичем Толстым, который снял весь верхний этаж. Вероятно, жена графа Анна Георгиевна купила усадьбу уже в конце 1847 — начале 1848 года.
После Октябрьской революции 1917 года дом стал муниципальной собственностью и использовался как жилье. В 1964 году здание было передано постоянному представительству Киргизской ССР при Совете Министров СССР, а затем Городской библиотеке № 2. В 1974 году при библиотеке были открыты две музейные комнаты, литературно-мемориальная экспозиция которых удостоилась высокой оценки академика Дмитрия Сергеевича Лихачева. В 1979 году библиотеке присвоили имя Н. В. Гоголя. В 2005 году учреждение было преобразовано в Центральную городскую библиотеку — мемориальный центр «Дом Гоголя», а в 2009 — в ГБУК «Дом Н. В. Гоголя — мемориальный музей и научная библиотека». Сегодня «Дом Гоголя» объединяет научную библиотеку, исследовательский центр, выставочный зал и мемориальный музей. Новая экспозиция музея была открыта 27 марта 2009 года к 200-летию со дня рождения писателя. На территории помещения можно увидеть памятник Н. В. Гоголю, созданный Н. А. Андреевым к 100-летию со дня рождения писателя, а также «Каретный сарай», хозяйственные помещения усадьбы.
Гоголь приехал жить в дом на Никитском бульваре в 1848 году, по приглашению графа А. П. Толстого и его жены, графини А. Г. Толстой, которые были близкими друзьями Гоголя. В каждой комнате дома есть главный предмет, который становится символической инсталляцией, выражающей акцент комнаты. В прихожей это сундук странствий, в гостиной — камин, в кабинете — конторка, в зале «Ревизор» — кресло, а в комнате памяти — посмертная маска Гоголя. Окружающие предметы мебели и детали интерьера включены в образ на уровне актеров «второго плана». Музейная экспозиция была создана научной концепцией, а художник Л. В. Озерников воплотил ее в жизнь. В музее собраны подлинные исторические предметы и произведения искусства, а также вещи, принадлежавшие Гоголю. В двух комнатах на первом этаже писатель работал над вторым томом «Мертвых душ». 5 ноября 1851 года, налево от входа в зал первого этажа, Гоголь читал комедию «Ревизор» актерам Малого театра, а также сжег часть своих рукописей за 10 дней до своей смерти в этом доме.
Согласно музейному сценарию, в правой половине дома посетитель проходит путь Гоголя-писателя, в левой — Гоголя, читающего свои произведения. На втором этаже экспозиции можно познакомиться с книгами Гоголя, исследованиями о его жизни и творчестве, а также увидеть портреты хозяев дома, гравюры и литографии с видами памятных мест, связанных с именем писателя. Согласно легенде, один из нотных альбомов, находящийся в нотно-музыкальном отделе дома, принадлежал графине А. Г. Толстой. Новая, расширенная и дополненная экспозиция музея была открыта 27 марта 2009 года, к 200-летию со дня рождения писателя.